Paint 機能でカスタムブラシの追加が簡単に出来ます。

1. 適当なブラシ用グレースケール（RGB でもいいんですが色は変換されちゃいます）の画像ファイルを用意。初期設定で入ってるのは 64 x 64 ピクセルのTIFFなんですが、これにこだわらなくて 128 x 128 の JPG とか GIF とかでも大丈夫みたいです。
2. このブラシ画像ファイルを Cheetah3D.app/Contents/PlubIns/brushes フォルダーへ。（Cheetah3D のアイコンを右クリック、'パッケージの内容を表示' をクリックして下階層のフォルダーを選んで下さい。）
3. もし Cheetah3D を起動していて Paint Tool 使用中だった場合は一回リセット（ Select Tool なりを選択）して、再度 Paint Tool を起動すれば新しいブラシが読み込まれます。

追記：バージョン 3.1 から、Application Support/Cheetah3D/ 内に、ブラシフォルダーが移るようようです。これで管理も楽になりますね。

この画像を、brushs フォルダーに追加すると、

こんな感じで使えます。

スタンプツールみたいには描けないんですけど、spacing をいじってコツをつかめばそれっぽくは出来ますね。